小智（松本梨香 配音）一行人在海上遇見了危險的風暴，流落到了橘子羣島中的亞西亞島上，這裏即將舉行熱鬧的大型慶典，而小智在意外之中遇見了慶典的聖女弗盧拉（平松晶子 配音）。弗盧拉選中了小智作爲慶典的“指揮者”，他的任務是前往三聖島，找到隱藏在島上的玻璃球。只有集齊三顆玻璃球，才能夠正式開啓慶典。 　　就這樣，小智和夥伴們踏上了尋找玻璃球的旅途，哪知道不僅遇到了前來搗亂的火箭隊，還遭到了閃電鳥的襲擊。就在千鈞一髮之際，吉爾露現身捕捉了閃電鳥，之後又企圖捕捉急凍鳥，吉爾露的最終目的，是召喚出傳說中的神獸洛奇亞。讓吉爾露沒有想到的是，火焰鳥、閃電鳥和急凍鳥之前竟然開始了激烈的戰鬥。