《海帆第二季》講述了一羣獲得了極星獎學金的學生們和極星號的船員本來打算到極星號船上橫跨大西洋度過2個月的學習時光，然而瑞士日內瓦的歐洲原子能研究中心的粒子加速器在科學家們進行一場祕密實驗之時出現了事故，陸地幾乎全部消失了，這艘船上的人成爲了全世界唯一的倖存者。從此踏上漫漫的尋找那僅存的一點陸地並重建家園的路途...可是，他們能順利找到陸地並重建家園嗎？在這艘船上的男男女女又會發生什麼樣的故事？