第一集中，變異人在X教授的指揮下，將邪惡的萬磁王打入冷宮，但是依然得不到社會的承認。在一次政治要人遭到暗殺後，所有的矛頭又一次指向變異人。這一次，X教授也感到壓力大增，以致於跟美國總統都要就此事進行磋商。一個擁有很高聲譽的前將軍，率領着反對變異人的聯盟連續對x教授施壓。萬磁王在這種情況下，不得不尋找與X教授聯手抵抗前將軍的方式。金鋼狼的身世也將在本集中進一步揭開。